Dans cette Coupe de France, les Girondins réalisent un parcours sans faute. Vainqueurs 4-1 du C.A. Paris, en huitièmes de finale de la zone occupée, ils écrasent Saint-Sevrain 7-3 en quarts, puis Rouen 4-1 en demi-finale, en raison de la géopolitique de l'époque, cette coupe se dispute en plusieurs finales.
Le dimanche 13 avril 1941, au Parc des Princes, les Girondins viennent affronter la formidable équipe parisienne du Red Star Olympique, leader du Championnat. Plus de 30 000 spectateurs sont là pour assister à la victoire de leurs favoris.
Pourtant c'est l'inter gauche bordelais Pruvot qui ouvre le score au bout d'un quart d'heure de jeu : une descente de Arnaudeau sur son aile gauche, une passe en retrait à Rummelhardt qui sert Pruvot dont le shoot aboutit dans la lucarne des buts de Da Rui irrémédiablement battu. Jouant prudemment après le repos , les Girondins ne procèdent plus que par contre-attaques, misant uniquement sur la vitesse de leurs ailiers et sur la puissance de Urtizberea. A dix minutes de la fin, un tir de ce dernier est dévié par l'arrière parisien Vandooren sur Szergo ; l'ailier droit " marine et blanc " seul devant Da Rui n'a aucune peine à le battre pour la seconde fois. Malgré la réussite de l'inter parisien Padron qui reprend de près une balle lâchée par Gérard, c'est le junior Arnaudeau qui, bien lancé par Urtizberea, prend son adversaire direct de vitesse, et d'un tir sec des vingt mètres bat, à la dernière minute, Da Rui pour la troisième fois.
le dimanche 18 mai à Colombes, les Girondins sont opposés au Toulouse FC vainqueur de la zone non occupée. Avec une équipe truffée d'internationaux de renom, les haut-Garonnais sont favoris. Mais, comme contre le Red Star, les Girondins partent en trombe et, dès la 4ème minute, ouvrent le score par un tir à bout portant de Pruvot qui a repris une tête de Urtizberea sur un corner de Szergo. A la 29ème minute, l'ailier droit bordelais s'échappe le long de la touche, fait un long centre qui aboutit à Arnaudeau dont le tir du droit va au fond des filets. Ce n'est qu'à deux minutes de la mi-temps que les Toulousains réduisent la marque . Arnaudeau à la 77ème minute , complètement démarqué et recevant une balle de Urtizberea, assure définitivement la victoire de son équipe.
Le 25 Mai 1941, à Saint-Ouen, 15230 spectateurs assistent à la victoire des hommes au Scapulaire 2-0 . La partie ardemment disputée est assez égale jusqu'au repos atteint sur un score vierge. En seconde mi-temps, les Girondins accentuent leur pression : sur un tir de Urtizberea, le poteau sauve encore les Nordistes. Mais, au bout d'heure de jeu, Urtizberea, qui n'avait pas eu l'occasion de scorer lors des deux précédentes rencontres, a sa récompense : il ouvre la marque en reprenant de près un centre de Szergo. Coup de théâtre : à un quart d'heure de la fin, Ben Ali touche le ballon de la main dans la surface de réparation. leur inter droit Dudziack, envoie le ballon à côté. Et c'est Urtizberea qui, à la 83ème minute, assure définitivement la victoire des couleurs " marine et blanc " en détournant dans les filets un nouveau centre de Szergo.
Les héros sont : Gérard dans les buts, Homar et Mancisdior en latéraux, Ben Ali, Pléziak et Rummerhardt en demis, Szego, Lopez, Urtizberea, Pruvost et Arnaudeau en attaque.