Après ce titre les girondins rentrent , hélas , dans le rang L'année 1951 est moins brillante : malgré le renfort de l'ailier de l'équipe de France, Henri Baillot, les Girondins finissent 6èmes.
Les choses s'améliorent en 1952, et le doublé aurait pu être au bout sans une grande équipe de Nice. Bordeaux fait à nouveau parler la poudre : comme en 1950, les Girondins possèdent la meilleure attaque avec 88 buts, atomisant au passage St Etienne 9-0. Mais cette fois, cela ne suffit pas.
Les Girondins échouent à un tout petit point de l'O.G.C. Nice. En Coupe, les Girondins atteignent la finale pour la troisième fois de leur histoire, en éliminant difficilement le Stade Français, puis Rennes, et enfin Lille. Leur ultime adversaire : Nice... Ce 4 Mai 1952 à Colombes, 61485 personnes assistent à une des plus belles finales de Coupe qui soit, entre les deux meilleures équipes du moment. Dans un match fou, les Girondins ne peuvent empêcher les Niçois de réaliser le doublé. Nuremberg ouvre la marque pour Nice, Baillot égalise, Carniglia puis Belver redonnent de l'air aux azuréens, mais Kargu puis à nouveau Baillot marquent ! 3-3 à l'heure de jeu ! Hélas, Ben Tifour et Cesari donnent la victoire au Gym. Score final : 5-3 pour Nice !
Les années suivantes, les Girondins se comportent bien : troisièmes en 53 et 54 (avec un titre de meilleur buteur pour Kargu, 27 réalisations), sixièmes en 55. Mais le club marque le pas, s'endort.
La Coupe 1955 entretient cependant l'illusion. Les Girondins se fraient une nouvelle fois un chemin jusqu'en finale. Mais cette fois, la défaite est sans appel. Ce 29 Mai 1955, devant 49411 personnes, les surprenants Lillois, pourtant mal classés en championnat, ne laissent aucune chance aux bordelais. 4-0 après 35 minutes, score final 5-2, rien à dire.
Plus dure sera la chute : en 1956, c'est la débandade. Bordeaux finit 17ème sur 18 et retrouve la D2. André Gérard est remplacé par Camille Libar; de Harder, Grimonpon, Gallice, Swiatek prennent leur retraite, de nombreux joueurs s'en vont...
Les Girondins restent en D2 en 1957 et 1958, et remontent de justesse en 1958. Ils décrochent la 4ème place synonyme de D1 lors de la dernière journée, en battant Grenoble 2-0 dans un stade vélodrome archi-comble.
Mais en 1959-1960, c'est l'humiliation. Bordeaux finit bon dernier, à 10 points du premier non-relégué. Et surtout, la défense girondine encaisse la bagatelle de 102 buts ! C'est la plus mauvaise saison de tous les temps pour les Girondins...